A Direção-Geral constitui o principal órgão de gestão do Campus, sendo responsável pela condução administrativa e institucional da unidade. Sua atuação está voltada à coordenação das atividades acadêmicas, administrativas e operacionais, buscando assegurar o adequado funcionamento do Campus e o cumprimento de suas finalidades institucionais. Cabe ainda à Direção-Geral representar o Campus perante a Reitoria, os demais órgãos do Instituto Federal do Amapá (IFAP) e as instituições públicas e privadas com as quais mantém relacionamento.

Entre suas principais atribuições, destacam-se:

• Coordenar e supervisionar as atividades administrativas e acadêmicas desenvolvidas no Campus;
• Representar institucionalmente o Campus junto à Reitoria, à comunidade acadêmica e a instituições externas;
• Gerir e acompanhar a aplicação dos recursos orçamentários e financeiros destinados à unidade;
• Promover o planejamento e o acompanhamento das ações institucionais do Campus, em consonância com as diretrizes do IFAP;
• Coordenar e acompanhar o funcionamento dos setores e órgãos colegiados da unidade;
• Designar servidores para funções e comissões, observadas as competências e normas institucionais;
• Zelar pelo cumprimento das normas, regulamentos e demais atos institucionais;
• Fomentar a integração entre Ensino, Pesquisa, Extensão e demais áreas que compõem a atuação do Campus;
• Representar o Campus em eventos, reuniões e solenidades oficiais, fortalecendo sua articulação com a comunidade e com outras instituições.